A teoria da endossimbiose, criada por Lynn Margulis, propõe que organelas, ou organóides, que compõem as eucélulas tenham surgido como conseqüência de uma associação simbiótica estável entre organismos. A idéia de que a célula eucariótica ou eucarionte é na verdade uma colônia de microorganismos foi sugerida pela primeira vez em 1920, pelo biólogo americano Ivan Wallin. A principal implicação da endossimbiogênese é a de que os eucariotas são, de fato, quimeras produzidas pela combinação de diversos genomas de procariontes.