Esta é uma lista de rios da Estônia.
A
Aavoja - Agali - Ahja - Alajõgi - Allika - Ambla - Amme - Angerja - Antsla - Apna - Aruküla - Atla - Audru - Avaste - Avijõgi
E
Emajõgi - Elbu - Elva - Enge - Erra - Esna
G
H
Haavakivi - Halliste - Harku - Helme - Hilba - Humalaste - Hundikuristiku - Härjapea - Häädemeeste - Hüüru
J
Jaama - Jurga - Jõelähtme - Jõku - Jägala - Jänijõgi - Järveotsa
K
Kalita - Kalli - Kargaja - Kasari - Kata - Katku - Kavilda - Keila - Kloostri - Kodila - Kohtra - Kolga - Kolga - Koosa - Kroodi - Kuivajõgi - Kuke - Kulgu - Kullavere - Kunda - Kurina - Kurna - Kuura - Kõpu - Kärla - Käru - Kääpa - Külge
L
Laatre - Laeva - Lahavere - Leevi - Leisi - Lemmejõgi - Lemmjõgi - Liivi - Lintsi - Lodja - Loo - Loobu - Luguse - Luutsna - Lõve - Lähkma
M
Maadevahe - Maidla - Massu - Munalaskme - Mustajõgi - Mustjõgi (Endla) - Mustjõgi (bacia do Gauja) - Mustjõgi (bacia do Jägala) - Mustjõgi (Tallinn) - Mustoja (Lahemaa) - Mustvee - Muuga - Mõra - Mädajõgi - Mädara - Mähe
N
Nahavere - Naravere - Narva - Nasva - Nurtu - Navesti - Nuutri - Nõva
O
P
Paadrema - Paala - Pada - Pala - Pale - Paltra - Pede - Pedeli - Pedja - Peeda - Peetri - Penijõgi - Piigaste - Piilsi - Pikknurme - Pirita - Piusa - Porijõgi - Poruni - Prandi - Preedi - Punapea - Purtse - Põduste - Põltsamaa - Pärlijõgi - Pärnu - Pääsküla - Pühajõgi (Ida-Virumaa) - Pühajõgi (Saaremaa)
R
Raasiku - Rannametsa - Rannamõisa - Rannapungerja - Raudna - Reiu - Reopalu - Retla - Riguldi - Räpu
S
Rio Saarjõgi - Saki - Saku - Salajõgi - Salla - Salme - Sauga - Selja - Sigaste - Sillaorsa - Sitapätsi - Soodla - Struuga (Jaama) - Surju - Surjupera - Suuremõisa - Sõmeru - Sõtke - Sämi
T
Taebla - Tagajõgi - Tarvastu - Tatra - Teenuse - Timmkanal - Tirtsi - Tiskre - Toolse - Topi - Tori - Treppoja - Tuhala - Tuudi - Tänassilma - Tõdva - Tõlla - Tõrvanõmme - Tõstamaa
U
Ulila - Umbusi - Ura - Uueveski
V
Vaemla - Vaidava - Vainupea - Valgejõgi - Valuoja - Vara - Vardi - Vardja - Varsaallika - Vasalemma - Vaskjõgi - Veelikse - Velise - Vigala - Vihterpalu - Visela - Visula - Vodja - Vorsti - Võhandu - Võhkse - Võhu - Võlupe - Võsu - Väike Emajõgi - Vändra - Värska - Vääna